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研究团队将PocketXMol应用于设计caspase-9小分子抑制剂，其效力与商业化的泛caspase抑制剂相当；研究团队还使用PocketXMol生成了PD-L1结合多肽，成功率远超文库筛选，结合亲和力达纳摩尔级，可特异性结合 PD-L1 阳性细胞，配体抑制实验和体内肺肿瘤成像验证了其治疗和诊断潜力。PocketXMol在13个计算基准中的11个上取得了最先进（SOTA）表现，在其余2个中也保持了竞争力，超越了55个基线模型。
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